内蒙古财经学院始建于1960年,后几经更名,1979年恢复本科教育,1980年经国务院批准重建。1997年学院通过原国家教委的本科教学工作合格评估,2000年与原内蒙古经济管理干部学院合并组建成新的内蒙古财经学院,2005年取得硕士学位授予权,2006年原内蒙古财税职业学院和原内蒙古工商学校并入内蒙古财经学院,同年顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估。经过近50年的建设和发展,学院办学规模越来越大,层次越来越高,实力越来越强,为自治区的经济建设和社会发展做出了重要贡献。
郭希哲:1992年1月至1995年8月任院长;王占荣:1995年8月至1997年3月任院党委副书记兼院长;尹正业:1997年3月至2004年12月任院长;张亚民:2004年12月-现今